Магнитната помпа се състои от три части: помпа, магнитен съединител и задвижващ двигател. Левият край на вала на помпата е снабден с работно колело, десният край е снабден с вътрешен магнитен ротор, а валът на помпата се поддържа от плъзгащ лагер. Скобата свързва помпата и двигателя и осигурява точността на позицията на вътрешния и външния магнитен ротор. Когато моторът задвижва външния магнитен ротор да се върти, магнитното поле преминава през въздушната междина и изолиращата втулка, за да задвижи вътрешния магнитен ротор да се върти синхронно, като по този начин кара работното колело да се върти.
Помпите обикновено използват устойчиви на корозия инженерни пластмаси с висока якост, корундова керамика, неръждаема стомана и др. като производствени материали, които имат добра устойчивост на корозия и могат да предпазят транспортираната среда от замърсяване. Например частта от магнитната помпа от серията CQB, която контактува с транспортираната течност, е направена от устойчива на химикали флуоропластична сплав. Флуоропластичната сплав е съставена от полиперфлуоретилен пропилен с ултрависоко молекулно тегло, който може да бъде термопластифициран и смесен с една или повече други пластмаси и могат да се добавят пълнители. Например, пластмасова сплав, съставена от полиперфлуоретилен пропилен с ултрависоко молекулно тегло и политетрафлуоретилен, първият съставлява 0.1% до 99,9% от теглото, а последният представлява 99,9% спрямо 0. 1% тегловни и се произвежда чрез метод на смесване на сух прах съвместно смилане или мокър сух прах съвместно смилане. Различни продукти се обработват чрез горещо пресоване или студено пресоване, синтероване, което преодолява недостатъците на студения поток и лесната деформация на политетрафлуоретилена и може да удължи експлоатационния живот.
Лагерите на магнитната помпа са потопени в транспортната среда и се смазват и охлаждат от транспортната среда. По-често използваните лагери в Китай са предимно графитни и подсилени пластмаси. Графитът, особено импрегнираният графит, има добро самосмазване, устойчивост на топлинна корозия, нисък коефициент на триене и широк спектър от приложения, но графитът е крехък и има ниска якост. Той е много чувствителен към огъване на вала и локално претоварване и трябва да се обърне специално внимание. Трислойният композитен лагер със стомана като матрица, порест бронз като среден слой и пластмаса като повърхностен слой има висока якост на натиск, нисък коефициент на триене, стабилен размер и звукоизолация и поглъщане на удари и се използва през последните години .